微生物肥料是指特定微生物与营养物质复合而成，能提供、保持或改善植物营养，提高农产品产量或改善农产品品质的活体微生物制品。活化土壤，解磷解钾。微生物肥料含有大量有益微生物，能分解有机残体，形成土壤腐殖质，改善土壤结构和理化性状，可将植物不能吸收的物质转化为有效养分，供植物吸收利用。肥料进入土壤后，微生物在有机质、无机营养元素、水分、温度的协助下大量繁殖，减少了有害微生物群体。
化肥的实践运用率只要30%～45%。丢失的化肥一部分分化开释到大气中，一部分则随着水土流失掉了，还有一部分被固定在土壤中，不能被植物直接吸收运用。当施入有机肥后，因为有利生物活动改进了土壤结构，添加了土壤保水保肥才能，从而削减了营养的流失。加上有利微生物解磷解钾效果，能使化肥有效运用率进步到50%以上。
粪肥中含有丰富的有机质和作物所需要的各种营养元素，对增加作物产量和提高土壤肥力具有良好的作用，一直以来都被广泛应用于农业生产中。古时候就流传着“粪多则肥多，肥多则田沃，田沃则谷多”的说法。近年来，随着粪肥不合理的施用现象增多，各种问题也随之而来。
